某个工业地带陆陆续续出现怪兽？！弦人队长率领SKaRD进行迎击，打倒了接二连三的怪兽。SKaRD认为此事与该地带在进行怪兽残骸处理和研究的先进化学企业「尼克罗玛斯公司」有某种关系，SKaRD便急行前往

光之国受到不明敌人攻击，使得失去了一众新世代奥特曼的记忆，同时赛罗·奥特曼得到来自未来传送的新道具“次元卡读取机”，为了取回失去的记忆，新世代奥特曼们将要联手共同合作！

朝仓陆等人从伽古拉那得知巨大人工头脑吉尔巴利斯企图抹杀全宇宙的智慧生命体，它为了寻找“赤钢”准备向地球发起进攻。为了阻止吉尔巴利斯，小陆等人来到了冲绳寻找“赤钢”，并在那里遇到了库西亚人比嘉爱琉，在她的带领下，他们终于在石像前找到了“赤钢”，然而小陆却无法令“赤钢”觉醒。就在此时，吉尔巴利斯手下的加拉特隆军团出现了，它们向冲绳发起了攻击。小陆变身成捷德奥特曼与欧布奥特曼、赛罗奥特曼一起对抗敌人。